Depuis 2002, Philippe Rouy réalise des films entre essai documentaire et art vidéo. À partir de mars 2011, il se consacre à une trilogie documentaire centrée sur la catastrophe nucléaire de Fukushima : 4 bâtiments, face à la mer (2012), Machine to Machine (2013), et Fovea centralis (2014).
Réalisé à partir des images produites par l’industrie nucléaire japonaise elle-même, cet ensemble a été présenté dans des festivals comme FIDMarseille, Cinéma du réel (Paris), Torino Film Festival, Mumbai Film Festival, FICUNAM (Mexico), etc.
Depuis, son travail cinématographique est essentiellement tourné vers le Japon.